El pueblo y el monasterio se comunicaban directamente a través de un camino que salía del portal de Baix (portal de Abajo). El trazado actual coincide, prácticamente, con el original. Para facilitar el paso de los visitantes, hace unos años se acondicionaron unas escaleras al lado de las cuales se puede ver el antiguo camino.

Cerca del portal, el camino se transformaba en una calle del pueblo, al que tenían acceso las casas vecinas a través de pequeñas puertas, aún bien conservadas. Entre las casas, unas callejuelas lo comunican con la plaza de la iglesia.

A medida que crecía la población, el espacio original, alrededor de la iglesia, se quedaba pequeño y se empezó a construir en los márgenes del camino del monasterio hasta formar un rabal (barrio exterior) que, en la documentación del siglo XV, recibe el nombre de Sa Petja. No puede hacerse una estimación de su superficie total, pero probablemente, su crecimiento quedó limitado al este por la fuerte pendiente y al oeste por la roca de la montaña.

En el subsuelo de las viviendas, los arqueólogos han descubierto silos para el grano, anteriores a la construcción de las casas, así como canalizaciones excavadas en la roca para conducir las aguas pluviales montaña abajo.

Este portal, junto con el de arriba, es todo lo que queda del primitivo sistema de defensa del pueblo. No queda constancia de que éste fuera una muralla de piedra. Las excavaciones hacen pensar en un posible cerramiento con una empalizada de madera. Con el crecimiento del pueblo este sistema se anula y las casas, con sus muros macizos y las estrechas puertas, hacen la función de una auténtica villa cerrada.

El portal de Baix es la entrada al pueblo desde el camino del monasterio. Se encuenra en la planta baja de una bestorre, es decir, una torre que quqeda abierta hacia el interior del recinto. Cuesta imaginarse la forma original, no sólo por el estado de conservación sino también por las casas que se adosaron con el tiempo. De todas formas, no debía de ser demasiado diferente del portal de Dalt (portal de Arriba), de planta cuadrangular y unos 4'8 m de lado.

El portal forma un arco de medio punto, enmarcado con losas puestas de canto. Existen indicios del sistema de cierre con rastrillo, así como del arranque de la bóveda que cubría la entrada. También quedan restos de alguna tronera de defensa, anulada al adosarse las casas.

Las casas construidas alrededor de la plaza corresponden al núcleo urbano más antiguo, cuyos restos se remontan al siglo XII, aunque las estructuras que se pueden ver corresponden a la segunda mitad del siglo XV.

Son casas grandes, de entre 120 y 160 m² de superficie, con planta baja y piso, y cubierta de teja. Tienen cuatro o cinco estancias, alguna con función de patio o, incluso, de huerto, donde se cultivaban legumbres como habas y guisantes.

Los arqueólogos han encontrado restos de vajillas de mesa, de producción valenciana y catalana, cerámicas diversas de cocina y despensa, y para otros usos cotidianos, utensilios de hierro y bronce, como herramientas, cerraduras y llaves, y lámparas de aceite, o para indumentaria, como hebillas o agujas. La presencia de herramientas agrícolas hace pensar en que algunos habitantes trabajaban la viña así como los cereales, ya que se han encontrado semillas de cebada, trigo, mijo y maíz.

En una de las casas se ha localizado un conjunto de medidas para la venta de vino al por menor, lo que hace pensar en una posible taberna o tienda. En otra, la presencia de un inusual número de escudillas para comer podría indicar que se trataba de un hostal, quizás para los peregrinos que visitaban el monasterio.

Situada delante de la iglesia, esta plaza es el centro del pueblo, donde se concentra la actividad pública y donde confluyen los principales caminos de acceso al pueblo, así como buena parte de las calles y callejuelas. Según la documentación, allí se ponían las paradas del mercado semanal, al que debían acudir numerosos peregrinos que se dirigían al monasterio.

Aunque el pueblo se abandonó, la plaza siguió siendo el punto de encuentro de la fiesta de Santa Creu que, hasta el siglo XIX, reunía a los habitantes de los pueblos del cabo de Creus.

Tiene una forma irregular, con la superficie nivelada, y en su subsuelo se han encontrado restos del antiguo cementerio de tumbas antropomorfas. Este espacio coincide con el dextro de la iglesia, un espacio sacralizado que rodeaba la iglesia con un radio de entre veitne y treinta pasos de ancho, en el que no se podían cometer acciones violentas bajo amenaza de excomunión, y que por lo tanto proporcionaba un espacio de protección.

La iglesia es un elemento singular dentro del pueblo, ya que se levantó antes de la propia existencia de éste y su culto se mantuvo incluso cuando sus habitantes ya lo habían abandonado. Vinculada al monasterio, nació para dar servicio a la población que vivía dispersa por los alrededores. La primera advocación es a la Santa Cruz (Santa Creu), pero a principios del siglo XVI se dedicó a santa Helena.

Formalmente, la iglesia es el resultado de sucesivas reformas que la convierten en un edificio singular dentro del estilo románico. La iglesia original, del siglo IX, es de una sola nave y aprovecha una antigua torre vigía como ábside. En el siglo X u XI, la cabecera toma la forma actual, cuando se añade un nuevo ábside y dos capillas laterales a la torre.

La despoblación a partir del siglo XV provocó la decadencia del edificio y la pérdida de la condición de parroquia, de forma que a partir de 1563 pasó a ser administrada por el rector de la Selva de Mar.

En un intento por reactivar el culto, en el siglo XVII, el monasterio emprendió unas obras de ampliación levantando las naves laterales. Las obras comportaron la construcción de unas amplias arcadas de mármol gris local, para comunicar los laterales con la nave central, además del cambio de pavimento y una nueva cubierta de losas. Pero a pesar de estos esfuerzos, pronto se llevaron las campanas, el edificio se fue deteriorando y acabó custodiado por un ermitaño hasta finales del siglo XIX, cuando quedó completamente abandonado.

Después del abandono del pueblo y la pérdida de la condición de parroquia, la iglesia quedó bajo la cutodia de unermitaño. Según una visita pastoral de principios del siglo XVII, el ermitaño no disponía de casa propia y dormía dentro de la iglesia. El hecho de que el obispo no lo viera con buenos ojos impulsó, en la primera mitad del siglo XVIII, la construcción de esta casa, llamada también sacristía nueva.

Es una vivienda sencilla, con planta baja y piso, al que se accede tanto desde el interior de la iglesia como a través de la sacristía. En el piso superior, una puerta permite acceder al interior de la torre campanario, por encima de la cubierta de la bóveda. El tejado, que no se conserva, era de una sola vertiente, con pendiente hacia el sur.

En 1420 se adosó una nueva construcción en la cabecera de la iglesia para hacer las funciones de sacristía. Tenía planta baja, cubierta con bóveda de piedra, y un piso del que sólo quedan parte de los muros. La puerta conserva, en el dintel, una cruz grabada.

Desde aquí se administraba la parroquia, cuyas rentas pertenecían a Sant Pere de Rodes, ya que la iglesia era una posesión del monasterio. El abad también tenía la potestad de escoger a los clérigos. En los siglos XIV y XV, la iglesia estaba regida por tres hebdomadarios, además de un sacristán y algunos donados. estaban obbligados a residir en el pueblo, donde algunos de ellos tenían incluso más de una casa. Aunque, a mediados del siglo XVI, debido a la despoblación, pasó a hacerse cargo de ella el párroco de Sant Esteve de la Mata, de la Selva de Mar. De todas formas, hasta el siglo XVIII, se siguió utilizando la sacristía como un espacio funerario restringido.

Contrariamente a lo que hoy puede parecer, la zona donde se encuentra emplazado el pueblo era, en época medieval, muy activa y habitada. El monasterio de Sant Pere actuaba como un punto de atracción económica de primer orden. De ello se beneficiaban los habitantes de la zona que proporcionaban serviccios al monasterio y atendían a los peregrinos. Además, se dedicaban a explotar los recursos naturales disponibles, básicamente el cultivo de los cereales, la viña, el olivo y los pastos.

Gracias al tráfico que generaba el monasterio, el pueblo estaba bien comunicado con las principales poblaciones de alrededor como La Selva, La Vall, Llançà, Castelló d'Empúries o Roses, además de otros poblados, pedanías y masías dispersas, también bajo el dominio del monasterio.

El pueblo también se beneficiaba de los pueblos de mar cercanos. Dentro del campo visual de Santa Creu es necesario mencionar el puerto de La Vall y el que hoy es El Port de la Selva, llamado Port Llen en la época. Aquí había pequeñas edificaciones, llamadas tiendas, básicamente dedicadas a la explotación del mar, pero también al comercio a pequeña escala, de cabotaje, respaldados por puertos de mayor capacidad y movimiento, como los de Roses y Llançà, por citar los más cercanos.

Alrededor de la iglesia, a lo largo de los siglos, encontramos restos de diversos cementerios. El más antiguo es el de tumbas excavadas en la roca, de forma antropomorfa y con cubierta de losas, que se puede fechar entre los siglos X y XI. Dado que su existencia es anterior a la formación del pueblo, se encuentran restos en una amplia área que coincide con la superficie del dextro, incluso bajo las casas, cuya construcción las dañó mucho.

En el siglo XII, con el lugar ya habitado, el cementerio se organizó y se concentró justo al lado de la cabecera y al sur de la iglesia. Estas tumbas son más simples, primero con caja de losas y después con fosas simples excavadas en el suelo y ataúdes. Más adelante se ocupa el lado norte, con tumbas también muy simples.

La despoblación y la pérdida de la condición de parroquia marcan el fin de los entierros en Santa Creu, a pesar de los intentos posteriores de recuperar el culto obligando a los habitntes de la Selva y la Vall a oír misa y ser enterrados en el antiguo cementerio.

Es el elemento más antiguo de la iglesia. De hecho, es anterior a ésta, ya que funcionaba como una torre de vigilancia del territorio, con una vista excelente sobre la costa. Tiene planta cuadrada, de forma troncopiramidal, más ancha en la base. En origen estaba revocada con mortero de cal y algunos indicios apuntan a que estaba coronada por almenas.

Cuando se cosntruye la iglesia, en el siglo X, la nave se anexiona a la torre, que se aprovecha para ubicar el altar. Más tarde, se hace una nueva cabecera adosando a los lados de la torre dos capillas laterales y un nuevo ábside. Es en este momento cuando se practican las aberturas de la primera planta y se añaden elementos decorativos.

Posteriormente, se construye un campanario de espadaña para alojar dos campanas, ahora desaparecidas. Una se traslada en el siglo XVII a la iglesia de Sant Fruitós de la Vall y después a la de Sant Esteve de la Selva. A pesar de las reclamaciones de los obispos, no vuelve nunca. La otra la roban unos bandoleros a principios del siglo XIX. Sobre la bóveda de la nave central, aún se ven los agujeros para pasar la cuerda para tañerlas.

Al norte de la iglesia se ven las ruinas de un barrio que se extiende más allá del núcleo original. La primera línea de casas, con fachada a la plaza, no sería muy diferente del resto de viviendas en torno a la iglesia. en cambio, se desconoce cómo era el resto de las edificaciones y qué usos podrían tener, a falta de un estudio arqueológico.

La torre del portal de Dalt, junto con la del portal de Baix, es el testimonio del antiguo cerramiento del pueblo. De planta cuadrangular, la torre cuenta con sólidos muros de un metro de grueso y conserva algunas aspilleras. Es del tipo bestorre, es decir, una torre abierta hacia el interior del recinto. Gracias a la altura que se ha conservado, se ha constatado que disponía de dos plantas, separadas por una bóveda de piedra.

El portal perdió su función cuando el crecimiento demográfico de los siglos XII y XIV provocó la expansión del pueblo. Las nuevas casas se adosaron al portal y se extendieron más all´, de manera que lo anularon como elemento defensivo y quedó reducido a un mero portal de entrada.

Las huellas existentes sobre la roca dejan entrever un paso continuado de personas e, incluso, de vehículos, por las marcas de roderas de carros. La posición de las casas adosadas a la torre, sin embargo, debía dificultar y quizás impedir la maniobralidad.

Los primeros trabajos de recuperación de este conjunto arqueológico se hicieron en el año 1072, de forma paralela a la apertura de la carretera del monasterio. Se retauraronlos portales y se rebajaron las tierras de alrededor de la iglesia, dejando al descubierto algunos muros del pueblo. En la misma época, también se llevaron a cabo trabajos de limpieza y consolidación en la iglesia.

En los años noventa se excavó la iglesia y se emprendió una restauración que consistió en la limpieza de cubiertas y muros, la colocación de nuevo pavimento y la recuperación de las antiguas aberturas de la iglesia y el campanario.

En el año 2006 se inician unas campañas anuales de excavación, gracias a un convenio entre la Universitat de Barcelona y el Museu d'Història de Catalunya, con la colaboración de la Dirección General de Archivos, Bibliotecas, Museos y Patrimonio del Departamento de Cultura de la Generalitat de Catalunya y el Ayuntamiento del Port de la Selva. Estos trabajos han permitido no sólo adecuar el entorno para la visita, sino profundizar en el conocimiento del pueblo medieval.

Desde el portal de Dalt (portal de Arriba) se sigue un camino, bastante coincidente con el original, que comunicaba el pueblo de Santa Creu con otras problaciones a ambos lados de la montaña. se conoce su conexión con vías públicas que se dirigían hacia el lado de Vilajuïga, Pau y Palau, y desde aquí hasta Castelló d'Empúries y Roses, así como por el lado de Llançà. Aún se conservan tramos de estas cañadas, en gran parte protegidas por altos muros de piedra en los laterales.

Cerca de la entrada de la población, en el margen derecho del camino, se conoce la existencia de una fuente, hoy en día cubierta por la vegetación.